Окрім офіційної заборони в Палаті представників США через проблеми з безпекою та відсутністю шифрування збережених даних, низка країн висловлює серйозне занепокоєння щодо використання додатку.
У 2019-му месенджер був інфікований шпигунським ПЗ Pegasus, яке могло встановлюватися без дій користувача через «zero-click» атаку.
У 2025 році з ізраїльською компанією Paragon Solutions пов’язали хвилю кібератак — понад 90 жертв.
Павло Дуров публічно називав WhatsApp інструментом стеження, підозрюючи вбудовані backdoor-уразливості.
Meta об’єднує дані WhatsApp з іншими сервісами для реклами, що хоч і не порушує пряме шифрування, але дає ширший доступ до приватної інформації.
Месенджер фіксує вашу геолокацію, список контактів, частоту й інтенсивність спілкування — усе це може бути використано для профілювання.
Попри численні попередження, WhatsApp досі активно використовують українські військові, розвідники та волонтери — що може створювати потенційні ризики для безпеки країни.